Вперёд, Анпанман! Давайте победим корабль с привидениями!!

Алхимия представляет собой дисциплину, основанную на строгих принципах и ограничениях. Ключевым законом является запрет на нарушение природного равновесия, в частности, создание большего из меньшего. Отдельным и строжайшим табу является попытка сотворения человека. Братья Эдвард и Альфонс Элрики, изучавшие алхимию с детства, решаются нарушить этот запрет, чтобы воскресить свою умершую мать.

Попытка проведения запрещенного оборачивается для братьев тяжелыми последствиями. В процессе трансмутации Эдвард теряет левую ногу, а Альфонс лишается всего физического тела, его душа перемещается в соседний доспех. Стремясь исправить свою ошибку и вернуть Альфонсу прежнее тело, Эдвард становится государственным алхимиком. Эта должность предоставляет ему доступ к ресурсам и знаниям, необходимым для поиска способа обратного превращения.